52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1019 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  330  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  70.62 
 
 
160 aa  233  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  204  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  60.25 
 
 
170 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  58.13 
 
 
171 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  58.75 
 
 
164 aa  191  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  58.75 
 
 
164 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  58.75 
 
 
164 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  57.5 
 
 
165 aa  186  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
163 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  57.5 
 
 
165 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  57.5 
 
 
165 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  57.5 
 
 
165 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  184  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
183 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  46.34 
 
 
164 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
170 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  34.16 
 
 
173 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
171 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
167 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  32.59 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  39.42 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
166 aa  87  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
180 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.571408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0190809  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0406  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  22.22 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  19.31 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
167 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>