54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1374 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  100 
 
 		 171 aa  360  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  95.73 
 
 		 164 aa  333  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  95.12 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  94.51 
 
 		 164 aa  331  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  92.64 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  90.85 
 
 		 165 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  90.24 
 
 		 165 aa  313  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  90.24 
 
 		 165 aa  313  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  90.24 
 
 		 165 aa  313  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  67.3 
 
 		 159 aa  224  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  58.13 
 
 		 161 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  53.75 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  56.88 
 
 		 160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  54.72 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  34.11 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  33.33 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  34.93 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  35.9 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1520  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2523  carbon-nitrogen hydrolase  25.68 
 
 		 523 aa  44.3  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0190809  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3872  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.21 
 
 		 520 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00254916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1328  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.73 
 
 		 521 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.295591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.58 
 
 		 371 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1460  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.66 
 
 		 514 aa  41.6  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307905  normal  0.011499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  26.85 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>