52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0944 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  350  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  60.25 
 
 
161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  59.75 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  59.12 
 
 
160 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
165 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
165 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  55.62 
 
 
163 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
165 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  55.62 
 
 
165 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  53.75 
 
 
171 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  53.12 
 
 
164 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  53.12 
 
 
164 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  52.5 
 
 
164 aa  184  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  53.21 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  48.75 
 
 
183 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
164 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 
158 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
167 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
169 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  33.96 
 
 
169 aa  99  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
165 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  41.04 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  38.52 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
180 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  38.97 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  32.86 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
166 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1545  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0190809  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0406  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  23.78 
 
 
175 aa  47.4  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  24.32 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1783  acetyltransferase  26.71 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  22.97 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.571408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>