50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3164 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
165 aa  337  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  61.49 
 
 
166 aa  196  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  63.92 
 
 
171 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
167 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  56.52 
 
 
173 aa  178  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  60.49 
 
 
180 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  50.31 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  49.69 
 
 
169 aa  160  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  49.06 
 
 
169 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  50.91 
 
 
176 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  49.37 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
173 aa  136  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
168 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
170 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  36.25 
 
 
159 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  46.9 
 
 
171 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
164 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
161 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
164 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
160 aa  101  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
165 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  35.37 
 
 
171 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 
163 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
166 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  37.96 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  34.56 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0989  acetyltransferase  26.86 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137577  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1520  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4620  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  21.31 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.571408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>