49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4654 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  70.41 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  44.63 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  38.79 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 164 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 165 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 165 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 165 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  33.33 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  32.52 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  34.15 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  26.83 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  26.22 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 		 180 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2459  acetyltransferase  29.27 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.18 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  22.54 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0488  acetyltransferase, GNAT family protein  24.59 
 
 		 185 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>