200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2795 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2795  acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  362  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13520  Acetyltransferase  68.05 
 
 
185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00036036  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3171  acetyltransferase  54.49 
 
 
178 aa  210  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0939  GCN5-related N-acetyltransferase  52.25 
 
 
178 aa  204  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0249  GCN5-related N-acetyltransferase  52.22 
 
 
180 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0967  putative acetyltransferase  50 
 
 
180 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.268857  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1691  hypothetical protein  33.11 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0148158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0152  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
184 aa  87.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.778253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04173  predicted acetyltransferase  27.98 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3692  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04135  hypothetical protein  27.98 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1215  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  34.55 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0186  putative acetyltransferase  29.61 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2746  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000002917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  33.64 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  35.96 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  35.96 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
180 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  35.96 
 
 
174 aa  60.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  35.96 
 
 
174 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  35.96 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2918  hypothetical protein  28.78 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.638339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.611094  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  27.82 
 
 
168 aa  57.8  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  23.36 
 
 
173 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03023  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3450  acetyltransferase  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4474  acetyltransferase, GNAT family  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3637  acetyltransferase  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02974  hypothetical protein  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3348  acetyltransferase  31.96 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  34.83 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3726  acetyltransferase  33.02 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232857  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  34.83 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  44.44 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3352  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3627  acetyltransferase, GNAT family  32.99 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654924  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3459  acetyltransferase, GNAT family  32.99 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3567  GNAT family acetyltransferase  32.99 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3530  acetyltransferase, GNAT family  32.99 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3461  GNAT family acetyltransferase  32.99 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2865  acetyltransferase  24.81 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3617  acetyltransferase, GNAT family  30.93 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0177  acetyltransferase  31.25 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2461  acetyltransferase  23.81 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2341  acetyltransferase  23.81 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254593  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1629  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348184  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2105  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0176775 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  27.07 
 
 
186 aa  54.7  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1551  acetyltransferase  28.97 
 
 
164 aa  54.7  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1445  acetyltransferase  23.81 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1936  acetyltransferase  23.81 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3369  acetyltransferase  23.81 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.435865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1209  acetyltransferase  23.81 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1499  acetyltransferase  28.97 
 
 
164 aa  54.7  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  31.09 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  30.25 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  23.85 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0224  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5137099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002621  acetyltransferase  24.26 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
207 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
167 aa  52  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
168 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
196 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2302  acetyltransferase  28.4 
 
 
177 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.765459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
180 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal  0.604007 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0139  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  25.19 
 
 
191 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0635  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
214 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000069147  unclonable  0.000000000111993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03385  hypothetical protein  25.74 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>