189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3239 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  85.54 
 
 
180 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  85.37 
 
 
166 aa  293  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  81.93 
 
 
186 aa  263  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  50 
 
 
168 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  52.47 
 
 
190 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  49.38 
 
 
186 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  48.77 
 
 
168 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  43.48 
 
 
185 aa  134  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
172 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
180 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
166 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 
178 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
168 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
190 aa  104  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
166 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  39.58 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
181 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
229 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  38.31 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
161 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  33.78 
 
 
161 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  33.77 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  32.91 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  29.73 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0186  putative acetyltransferase  38.41 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1361  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.415389  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1913  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  24.41 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348184  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6166  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  31.39 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 
166 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04173  predicted acetyltransferase  28.77 
 
 
181 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3692  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
181 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04135  hypothetical protein  28.77 
 
 
181 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  26.54 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  26.54 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  24.68 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  24.68 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  27.22 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1445  acetyltransferase  38.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2461  acetyltransferase  38.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1936  acetyltransferase  38.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3369  acetyltransferase  38.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.435865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2341  acetyltransferase  38.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1209  acetyltransferase  38.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2746  GCN5-related N-acetyltransferase  29.77 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000002917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  25.31 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1551  acetyltransferase  35.96 
 
 
164 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394216  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1215  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
165 aa  55.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3315  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718101  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1499  acetyltransferase  35.96 
 
 
164 aa  55.5  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2105  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
168 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0176775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>