183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0855 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
195 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  92.35 
 
 
195 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  91.26 
 
 
195 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  67.86 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  68.39 
 
 
197 aa  241  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  64.77 
 
 
200 aa  237  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  71.01 
 
 
199 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  65.84 
 
 
185 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  66.25 
 
 
187 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  68.94 
 
 
185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  68.32 
 
 
213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  54.64 
 
 
196 aa  175  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  63.12 
 
 
183 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  58.24 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  54.55 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  54.88 
 
 
193 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  54.07 
 
 
196 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  54.07 
 
 
196 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  51.41 
 
 
200 aa  167  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  65 
 
 
187 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
229 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  54.37 
 
 
194 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
183 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  48.77 
 
 
167 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  46.37 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  50.92 
 
 
166 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  47.83 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 
175 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  43.03 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  42.41 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  42.04 
 
 
170 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  39.52 
 
 
172 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  43.38 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  40.76 
 
 
180 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  42.65 
 
 
186 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
166 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
177 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  39.87 
 
 
161 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 
178 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  39.52 
 
 
181 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  38.75 
 
 
166 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
161 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
168 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
161 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
158 aa  99  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  39.31 
 
 
185 aa  89  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  43.61 
 
 
175 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  41.04 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  36.36 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  29.07 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  29.07 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  30.23 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  28.49 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  28.49 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  29.07 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  29.07 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  27.39 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  27.91 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  27.39 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1361  GCN5-related N-acetyltransferase  38.28 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  28.69 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  28.49 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
168 aa  61.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  25.43 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2925  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
174 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 
166 aa  58.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1445  acetyltransferase  41.54 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2461  acetyltransferase  41.54 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
269 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1936  acetyltransferase  41.54 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3369  acetyltransferase  41.54 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.435865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2341  acetyltransferase  41.54 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1209  acetyltransferase  41.54 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4800  acetyltransferase  33.58 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2181  acetyltransferase  32.59 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.915726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3713  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3579  acetyltransferase  33.88 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0506  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>