180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4872 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  87.06 
 
 
172 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  87.06 
 
 
172 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  79.89 
 
 
190 aa  288  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  78.82 
 
 
170 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  80.59 
 
 
178 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  75.72 
 
 
181 aa  263  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  62.96 
 
 
166 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  59.51 
 
 
164 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  61.73 
 
 
166 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  58.54 
 
 
167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  55.88 
 
 
174 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 
183 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  55.49 
 
 
166 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  53.37 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
168 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  48.47 
 
 
168 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  48.48 
 
 
186 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 
175 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  41.67 
 
 
185 aa  131  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
166 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
180 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
190 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  40.57 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  38.89 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
195 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
199 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  41.32 
 
 
177 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
229 aa  108  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
185 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
161 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 
200 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 
197 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
161 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  39.49 
 
 
197 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
186 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  39.61 
 
 
161 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
190 aa  98.2  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  39.62 
 
 
166 aa  97.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  38.79 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
196 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
200 aa  91.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
213 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  34.07 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  38.62 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1846  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  39.46 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2249  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155744  hitchhiker  0.000000143213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  29.93 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  25.75 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  29.76 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  26.95 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  29.76 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  29.76 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  26.95 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
214 aa  62  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  27.54 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  28.14 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  28.14 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0635  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000069147  unclonable  0.000000000111993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
176 aa  58.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
168 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
168 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0939  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3352  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3726  acetyltransferase  25.9 
 
 
212 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232857  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
331 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13520  Acetyltransferase  31.11 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00036036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0261476  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  24.12 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  24.12 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2925  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>