186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4193 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
172 aa  343  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  92.44 
 
 
172 aa  323  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  87.06 
 
 
180 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  77.33 
 
 
190 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  78.82 
 
 
178 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  75.29 
 
 
170 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  73.26 
 
 
181 aa  258  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  60 
 
 
164 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  58.02 
 
 
166 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  58.64 
 
 
166 aa  177  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
166 aa  173  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  54.94 
 
 
169 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  52.15 
 
 
168 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 
174 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  54.27 
 
 
167 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  53.66 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  50.92 
 
 
168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  50.31 
 
 
168 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  50.31 
 
 
186 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 
175 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  42.5 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  46.25 
 
 
190 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
180 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  41.32 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  38.89 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
197 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
161 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
188 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
186 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
200 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  42.36 
 
 
161 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
200 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
194 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
186 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
158 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  39.43 
 
 
195 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  36.71 
 
 
197 aa  98.2  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  38.99 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  39.52 
 
 
195 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 
196 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
196 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 
196 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  34.5 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1846  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155744  hitchhiker  0.000000143213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  29.09 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  22.29 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
168 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  24.85 
 
 
202 aa  60.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  29.23 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  27.69 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2249  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 
196 aa  57.4  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  29.23 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  26.92 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13520  Acetyltransferase  28.85 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00036036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  25.75 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  26.92 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  26.79 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0939  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  27.69 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  27.69 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  26.79 
 
 
174 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  26.79 
 
 
174 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0044  acetyltransferase  31.91 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000637954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2795  acetyltransferase  27.86 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3352  GCN5-related N-acetyltransferase  24.71 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3726  acetyltransferase  26.4 
 
 
212 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
166 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5849  putative acetyltransferase  44.07 
 
 
169 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>