185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3622 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  65.43 
 
 
166 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  67.92 
 
 
161 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  67.92 
 
 
161 aa  210  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  67.08 
 
 
161 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  61.73 
 
 
158 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  59.88 
 
 
166 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  48.19 
 
 
185 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
193 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  48.45 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  44.72 
 
 
207 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
195 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  45.27 
 
 
183 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
188 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
169 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
172 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  39.39 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
172 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  41.14 
 
 
197 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
164 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
190 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
190 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
174 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  43.79 
 
 
229 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
167 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
183 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  42.41 
 
 
195 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
196 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
195 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  41.36 
 
 
168 aa  97.8  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  35.52 
 
 
199 aa  97.4  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  38.22 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  40.74 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 
168 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  43.54 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
166 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  34.38 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  36.69 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_004310  BR1551  acetyltransferase  36.24 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394216  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1499  acetyltransferase  36.24 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  30.97 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  29.73 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  29.05 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03023  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4474  acetyltransferase, GNAT family  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3617  acetyltransferase, GNAT family  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3450  acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3713  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02974  hypothetical protein  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3579  acetyltransferase  36.13 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3348  acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3637  acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0186  putative acetyltransferase  35.29 
 
 
167 aa  60.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
174 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3567  GNAT family acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3461  GNAT family acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0608  putative acetyltransferase  30.47 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3530  acetyltransferase, GNAT family  32.05 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3459  acetyltransferase, GNAT family  32.05 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3627  acetyltransferase, GNAT family  32.05 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654924  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  34.45 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.611094  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4012  acetyltransferase  35.83 
 
 
168 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
172 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  30.32 
 
 
174 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1629  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  29.03 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>