199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2064 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  326  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  65.22 
 
 		 161 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  64.81 
 
 		 161 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  64.6 
 
 		 161 aa  204  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  67.3 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  68.39 
 
 		 166 aa  201  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  59.88 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  42.44 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  43.56 
 
 		 197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  46 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  47.79 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  43.29 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  40.49 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  42.68 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  38.41 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  40.76 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 		 181 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  40.37 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 		 172 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 		 180 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 		 213 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 194 aa  94.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  39.41 
 
 		 196 aa  94  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 		 196 aa  91.3  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  38.79 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 		 195 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 		 196 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  37.09 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 		 190 aa  84.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  46.03 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1551  acetyltransferase  37.93 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394216  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1499  acetyltransferase  37.93 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2249  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  29.73 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  33.33 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  29.89 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  29.89 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  29.89 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  30.23 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  30.23 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  29.07 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2458  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  30.46 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  28.49 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  29.61 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  28.95 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  32.59 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3713  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3579  acetyltransferase  32.54 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1215  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5053  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3454  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0506  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0608  putative acetyltransferase  30.37 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4012  acetyltransferase  32.94 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>