213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2771 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  80.61 
 
 
196 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  80.1 
 
 
196 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  77.04 
 
 
196 aa  301  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
200 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  60 
 
 
193 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  62.21 
 
 
185 aa  188  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
207 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  53.45 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  52.97 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  48.4 
 
 
199 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  59.88 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  59.88 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  52.94 
 
 
197 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  52.87 
 
 
187 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  51.76 
 
 
200 aa  157  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  55.81 
 
 
195 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  51.35 
 
 
197 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  57.23 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  55.36 
 
 
195 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  52.41 
 
 
194 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  54.07 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
169 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 
174 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  41.21 
 
 
166 aa  111  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
175 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 
190 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
158 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
188 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  40.8 
 
 
181 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  41.61 
 
 
166 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
168 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  40 
 
 
168 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  39.88 
 
 
170 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  35.93 
 
 
161 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  37.95 
 
 
166 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  39.39 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
168 aa  98.2  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  48.12 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
161 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
178 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
164 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 
172 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
180 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  36.76 
 
 
178 aa  88.2  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
175 aa  87.8  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  41.76 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
174 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  30.82 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  40.4 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  28.93 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  33.1 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  33.1 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  33.33 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  27.67 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  27.67 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  27.67 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  28.3 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  28.3 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  34.65 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  28.3 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0044  acetyltransferase  30.77 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000637954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155744  hitchhiker  0.000000143213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
172 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3454  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
167 aa  61.6  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
166 aa  61.2  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03023  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  30.06 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3450  acetyltransferase  30.06 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3530  acetyltransferase, GNAT family  30.3 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3627  acetyltransferase, GNAT family  30.3 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654924  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3348  acetyltransferase  30.06 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4474  acetyltransferase, GNAT family  30.06 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3461  GNAT family acetyltransferase  30.3 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02974  hypothetical protein  30.06 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0186  putative acetyltransferase  28.32 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>