177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3420 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
200 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  74 
 
 
199 aa  274  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  70.17 
 
 
195 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  68.51 
 
 
195 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  68.16 
 
 
195 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  68.54 
 
 
197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  65.17 
 
 
197 aa  214  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  58.64 
 
 
185 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  61.59 
 
 
207 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  50.27 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  50.86 
 
 
200 aa  165  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 
193 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  56.36 
 
 
183 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  50.27 
 
 
194 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  51.76 
 
 
196 aa  157  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  53.59 
 
 
213 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  58.02 
 
 
185 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  51.61 
 
 
196 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  57.58 
 
 
187 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  51.16 
 
 
196 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  51.16 
 
 
196 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  47.8 
 
 
166 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  45.66 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
167 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 
175 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  42.44 
 
 
190 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  45.06 
 
 
174 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  47.8 
 
 
166 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  42.01 
 
 
181 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
172 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
166 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  41.26 
 
 
168 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
178 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
172 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  40.56 
 
 
186 aa  104  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 
180 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  38.36 
 
 
170 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
168 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  39.75 
 
 
166 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  39.63 
 
 
177 aa  101  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
188 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  42.41 
 
 
175 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  40.27 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  40 
 
 
161 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
158 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  39.38 
 
 
161 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
190 aa  88.2  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
161 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  37.16 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  35.71 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  35.67 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  26.11 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  26.11 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  26.44 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  26.59 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  26.44 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  26.44 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  27.17 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  26.59 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  26.59 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  26.59 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1361  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
175 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
269 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
170 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
172 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3726  acetyltransferase  27.85 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232857  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
167 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0608  putative acetyltransferase  29.94 
 
 
167 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  25.29 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
168 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0506  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
167 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal  0.604007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2918  hypothetical protein  35.48 
 
 
163 aa  58.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.638339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3713  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3579  acetyltransferase  35.54 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0044  acetyltransferase  27.65 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000637954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
168 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>