152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0112 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
175 aa  346  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148335  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1024  acetyltransferase-like  50.92 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  52.1 
 
 
167 aa  154  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246929  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3420  GCN5-related N-acetyltransferase  42.41 
 
 
200 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3233  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
188 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.834458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  43.28 
 
 
199 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0195304  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  43.66 
 
 
195 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
229 aa  97.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
196 aa  94.4  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2139  GCN5-related N-acetyltransferase  41.45 
 
 
207 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  38.97 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  39.85 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0417954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  42.34 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342467  normal  0.730259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1348  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  39.85 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0424  GCN5-related N-acetyltransferase  42.34 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3622  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.597202  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4872  GCN5-related N-acetyltransferase  39.46 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  41.18 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  38.24 
 
 
196 aa  84.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1648  GCN5-related N-acetyltransferase  41.35 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
161 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0447  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2319  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0855  GCN5-related N-acetyltransferase  43.61 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4484  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4548  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2265  putative acetyltransferase  37.41 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2064  hypothetical protein  39.01 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1156  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0256637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  39.46 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  37.96 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1011  acetyltransferase, GNAT family protein  33.13 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.725408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3230  GCN5-related N-acetyltransferase  35.07 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  36.3 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  35.56 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  31.75 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  31.75 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  31.75 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3239  acetyltransferase  34.29 
 
 
191 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  31.75 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  30.47 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  30.47 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  30.47 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  32.03 
 
 
174 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5053  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 
186 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0147908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1215  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
165 aa  57.8  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  40.45 
 
 
314 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
331 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  34.35 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0261476  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4543  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  30.58 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  41.28 
 
 
183 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
201 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1846  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3315  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718101  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1551  acetyltransferase  39.53 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394216  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1499  acetyltransferase  39.53 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  26.5 
 
 
211 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00772  acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
202 aa  51.2  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
214 aa  50.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3352  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>