144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0977 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.268857  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3171  acetyltransferase  44.44 
 
 
178 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0967  putative acetyltransferase  43.02 
 
 
180 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2795  acetyltransferase  40.91 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0939  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0249  GCN5-related N-acetyltransferase  42.46 
 
 
180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13520  Acetyltransferase  42.11 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00036036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0152  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.778253  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
165 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348184  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04173  predicted acetyltransferase  31.3 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3692  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04135  hypothetical protein  31.3 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.611094  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1215  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
165 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1691  hypothetical protein  32.69 
 
 
184 aa  55.5  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0148158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0608  putative acetyltransferase  29.17 
 
 
167 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 
170 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
166 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1629  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002621  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2181  acetyltransferase  29.11 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.915726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1551  acetyltransferase  32.05 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394216  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1499  acetyltransferase  32.05 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1560  acetyltransferase  27.78 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  28.95 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  28.21 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03385  hypothetical protein  33.78 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  26.79 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6166  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1913  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4543  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0506  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
168 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
161 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  25.89 
 
 
174 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3617  acetyltransferase, GNAT family  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03023  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02974  hypothetical protein  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0186  putative acetyltransferase  29.03 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4474  acetyltransferase, GNAT family  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3348  acetyltransferase  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3637  acetyltransferase  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3450  acetyltransferase  31.53 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3061  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
180 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.721214  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
269 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2797  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
166 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
169 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.248664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2918  hypothetical protein  35.06 
 
 
163 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.638339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0596  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
180 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3627  acetyltransferase, GNAT family  30.63 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654924  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3530  acetyltransferase, GNAT family  30.63 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3459  acetyltransferase, GNAT family  30.63 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3461  GNAT family acetyltransferase  30.63 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3579  acetyltransferase  30.28 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3713  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3567  GNAT family acetyltransferase  30.63 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
161 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1508  acetyltransferase  26.98 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.415389  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  25.89 
 
 
174 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  25.89 
 
 
174 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1445  acetyltransferase  36.99 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
176 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3726  acetyltransferase  33.78 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232857  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2461  acetyltransferase  36.99 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2370  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
190 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  25.89 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1936  acetyltransferase  36.99 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3369  acetyltransferase  36.99 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.435865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2341  acetyltransferase  36.99 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1209  acetyltransferase  36.99 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
175 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4800  acetyltransferase  35.71 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5053  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0147908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1846  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0596  acetyltransferase  32.56 
 
 
173 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
172 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4740  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
168 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0069125  normal  0.108767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>