27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2333 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  518  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  29.69 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  29.06 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  25.37 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  29.96 
 
 		 327 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  29.6 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  26.39 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  25.52 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  24.15 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  26.91 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  28.5 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  28.95 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  26.54 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  27.54 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  31.43 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  27.54 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3973  hypothetical protein  27.11 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  27.97 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  23.77 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2938  hypothetical protein  43.94 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0676403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  26.53 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  60 
 
 		 320 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  26.12 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  32.65 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  29.17 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>