More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1854 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 549 aa  1130    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  33.97 
 
 		 546 aa  310  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  31.44 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  30.93 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  30.74 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  31 
 
 		 551 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  30.44 
 
 		 535 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  31.49 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  31.62 
 
 		 533 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  28.51 
 
 		 537 aa  210  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  25.88 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 547 aa  180  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  25.09 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  29.68 
 
 		 449 aa  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 577 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  22.14 
 
 		 561 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  25.55 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  21.93 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  26.48 
 
 		 421 aa  127  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  28.33 
 
 		 561 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  26.01 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  28.07 
 
 		 555 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  22.29 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  28.62 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  24.5 
 
 		 539 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1860  putative response regulator  25.1 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.436307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 129 aa  74.3  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  20.87 
 
 		 533 aa  73.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 126 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  32.54 
 
 		 127 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 133 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  31.75 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 129 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  31.4 
 
 		 148 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 122 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  32.23 
 
 		 124 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  33.06 
 
 		 128 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  30.71 
 
 		 131 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 129 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 127 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 135 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 128 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  33.33 
 
 		 130 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  33.33 
 
 		 130 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 130 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 124 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  30.58 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 126 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 127 aa  67.4  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  30.58 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 128 aa  67  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 126 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 131 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 130 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  30.33 
 
 		 129 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  29.13 
 
 		 131 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  31.4 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  31.4 
 
 		 124 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  29.51 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  30.58 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  30.58 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  30.58 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 128 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  28.35 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 128 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 126 aa  64.7  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  29.75 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  29.75 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>