65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4386 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009036  Sbal_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.684002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  49.4 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  49.4 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  35.79 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  34.74 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  38.32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  38.1 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  38.1 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  38.1 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  36.78 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  38.1 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  42.25 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  32.97 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  35.24 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  37.14 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  36.49 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  37.84 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  38.55 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  36.49 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  39.19 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  39.19 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  34.78 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  38.16 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  33.75 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.62 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  34.72 
 
 		 373 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  31.63 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  35.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  36.11 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  33.33 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  33.78 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  33.73 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  32.43 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  34.72 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  39.51 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  30.56 
 
 		 411 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  42.47 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.93 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  32.43 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  32.43 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  37.84 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  48.65 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  48.65 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  37.18 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  30.86 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  30 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  31.33 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  31.08 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  31.71 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  35.06 
 
 		 253 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  36.62 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  36.62 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>