43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3647 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 397 aa  822    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  99.24 
 
 		 397 aa  818    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  99.24 
 
 		 397 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  98.99 
 
 		 397 aa  816    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  73.94 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  73.94 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  71.5 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  71.5 
 
 		 395 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  53.59 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  53.58 
 
 		 386 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  54.23 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  51.44 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  52.12 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  33.51 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  33.22 
 
 		 394 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  29.79 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  29.32 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  26.55 
 
 		 278 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  28.28 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.45 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.57 
 
 		 810 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 878 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 988 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  30 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 1112 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1676 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.33 
 
 		 733 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1285 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.23 
 
 		 816 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 		 1288 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.52 
 
 		 587 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 781 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 375 aa  43.1  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>