22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0885 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  98.69 
 
 
153 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  96.08 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  71.9 
 
 
153 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  71.9 
 
 
153 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  71.9 
 
 
153 aa  215  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  70.47 
 
 
164 aa  206  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  74.45 
 
 
137 aa  190  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  52.59 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  47.37 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  51.06 
 
 
145 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  45.71 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  45.07 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  46.76 
 
 
149 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  41.01 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  33.62 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  32.76 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  32.35 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  29.23 
 
 
198 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  24.34 
 
 
173 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>