34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0386 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0386  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 129 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1279  XRE family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0249  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2913  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 513 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 491 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1149  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.016899  hitchhiker  0.00000234075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  32.79 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1224  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 75 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  30.56 
 
 		 524 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  30.67 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  26.51 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1148  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.58 
 
 		 508 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 145 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>