156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4921 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  99.72 
 
 		 357 aa  734    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  99.72 
 
 		 357 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  85.71 
 
 		 364 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  99.44 
 
 		 357 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  86.55 
 
 		 364 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  85.99 
 
 		 357 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  85.99 
 
 		 364 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  99.44 
 
 		 357 aa  733    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  99.44 
 
 		 357 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  86.27 
 
 		 357 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  99.44 
 
 		 357 aa  731    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  98.6 
 
 		 357 aa  729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  99.72 
 
 		 357 aa  734    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  100 
 
 		 357 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  77.03 
 
 		 356 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  65.89 
 
 		 373 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  63.79 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  65.38 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  69.77 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  38.26 
 
 		 638 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  39.09 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  38.28 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  37.42 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  38.59 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  40.35 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  36.1 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  35.67 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  35.06 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  35.65 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  35.4 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  36.48 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  37.7 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  33.13 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  37.14 
 
 		 282 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  34.88 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.82 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  34.64 
 
 		 287 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  32.73 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  32.73 
 
 		 389 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  40.62 
 
 		 381 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  28.04 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  28.04 
 
 		 290 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  28.04 
 
 		 290 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  29.82 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  28.9 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  28.73 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  28.88 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  28.88 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  28.88 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  28.88 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  28.88 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  28.88 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  30.24 
 
 		 283 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  28.73 
 
 		 284 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  29.02 
 
 		 289 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  28.52 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  30.48 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  26.64 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  26.9 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  26.46 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  26.6 
 
 		 293 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  27.64 
 
 		 284 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  27.96 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  26.6 
 
 		 293 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  24.54 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  28.85 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  30.99 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  26.91 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  27.17 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  28.15 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  27.76 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  27.17 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  27.17 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  27.38 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  27.17 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  27.17 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  25.49 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  25.48 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  28.06 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  31.98 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  22.3 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  21.93 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  24.27 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  32.45 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  23.69 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  31.84 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.96 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  25.87 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.19 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  27.46 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.79 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  26.62 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  26.24 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  27.67 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  27.42 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  26.11 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.47 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  25 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.7 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>