29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2955 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  511  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  56 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  36.13 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  35.44 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  31.76 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  32.58 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  29.91 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  29.83 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.4 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.34 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.21 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.34 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  36.25 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.96 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.8 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  35.37 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  31.65 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  29.11 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  30.09 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  32.11 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  32.11 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  32.11 
 
 		 272 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  29.01 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  31.19 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  29.27 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  31.19 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  31.19 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  31.19 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  30.28 
 
 		 272 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>