More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0863 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 461 aa  914    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  71.55 
 
 		 454 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  67.25 
 
 		 456 aa  621  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  55.6 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  55.96 
 
 		 490 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  54.88 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  55.3 
 
 		 473 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  53.97 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  53.57 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  53.07 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  55.7 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  55.39 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  53.49 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  52.72 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  55.6 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  53.38 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  53.05 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  52.94 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  52.58 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  52.4 
 
 		 602 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  53.8 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  53.38 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  56.21 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  55.63 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  54.07 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  52.93 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  54.9 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  54.9 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  50.7 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  54.6 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  55.34 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  55.08 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  50.21 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  53.72 
 
 		 487 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  52.49 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  53.5 
 
 		 487 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  53.5 
 
 		 487 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  50.21 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  50.87 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  48.58 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.22 
 
 		 444 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.04 
 
 		 438 aa  334  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  40.18 
 
 		 448 aa  332  9e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  39.16 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  38.13 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  38.31 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  41.58 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  38.23 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.99 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  41.56 
 
 		 495 aa  326  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  38.19 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 440 aa  325  9e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  35.76 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  40.55 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  41.15 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  40.09 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  38.29 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.74 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40.4 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  38.85 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  40.35 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  40.42 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  40.22 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  40.97 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  40.54 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  38.51 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  40.52 
 
 		 567 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 		 447 aa  317  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  39.31 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  39.31 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  36.42 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.58 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  36.96 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  38.05 
 
 		 436 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  36.59 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  38.83 
 
 		 441 aa  313  5.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2303  GTP-binding protein EngA  39.05 
 
 		 447 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  37 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  38.19 
 
 		 449 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  39.05 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  39.38 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  39.38 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  40.66 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  39.38 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  38.73 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  38.44 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  39.52 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  36.92 
 
 		 438 aa  310  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>