48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0219 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  100 
 
 		 414 aa  812    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2866  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  35.82 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  33.15 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  22 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.56 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  25.59 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  22.31 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  27.92 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  25.82 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.71 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  23.4 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  29.38 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.64 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  27.75 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  23.71 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  23.71 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  25.67 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.06 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  25.93 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  26.5 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  24.79 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  26.24 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  25.39 
 
 		 358 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  27.12 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  19.69 
 
 		 439 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  20.66 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.15 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  31.71 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  21.27 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.25 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.22 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  31.33 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.67 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  19.86 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  26.07 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  25 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  24.02 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  21.03 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  21.03 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  23.02 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  23.02 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  19.52 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.49 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  22.42 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  28.38 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  24.8 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>