29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2434 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  52.45 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  54 
 
 
246 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  46.99 
 
 
163 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  34.01 
 
 
273 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  34.76 
 
 
235 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  28.38 
 
 
276 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  35.92 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  35.92 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  30.46 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  29.02 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  26.92 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  32.37 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4354  hypothetical protein  43.75 
 
 
152 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  26.11 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  29.73 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  29.73 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  20.6 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  20.6 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5728  hypothetical protein  48.57 
 
 
137 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.046672  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  26.76 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05440  hypothetical protein  52.27 
 
 
62 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  27.48 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  27.48 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  33.75 
 
 
126 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  25.57 
 
 
214 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2085  hypothetical protein  34.33 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  34.57 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  21.28 
 
 
205 aa  42.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>