More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2269 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  66.14 
 
 
261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  61.67 
 
 
250 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  62.2 
 
 
255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58.3 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  53.56 
 
 
243 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  62.82 
 
 
244 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  53.53 
 
 
248 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.03 
 
 
247 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.45 
 
 
239 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  41.91 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.21 
 
 
243 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.08 
 
 
264 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.8 
 
 
243 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.35 
 
 
242 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.15 
 
 
234 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.9 
 
 
168 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  43.93 
 
 
216 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  44 
 
 
259 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.44 
 
 
251 aa  121  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.18 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.89 
 
 
198 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  33.61 
 
 
597 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  26.84 
 
 
373 aa  98.6  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  33.18 
 
 
356 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.44 
 
 
699 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  36.32 
 
 
355 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.44 
 
 
700 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.27 
 
 
352 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2503  hypothetical protein  33.48 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  36.32 
 
 
366 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.84 
 
 
402 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.48 
 
 
375 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.24 
 
 
402 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  32.64 
 
 
344 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  26.83 
 
 
349 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  30.24 
 
 
402 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.61 
 
 
375 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.55 
 
 
337 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  36.64 
 
 
350 aa  91.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.41 
 
 
407 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  32.11 
 
 
346 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.33 
 
 
605 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.22 
 
 
357 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  33.33 
 
 
352 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.63 
 
 
368 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.65 
 
 
690 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.75 
 
 
396 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.31 
 
 
375 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1104  hypothetical protein  33.49 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241757  normal  0.525247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.63 
 
 
585 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.9 
 
 
381 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.64 
 
 
367 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.65 
 
 
338 aa  89  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  30.65 
 
 
881 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.56 
 
 
670 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.65 
 
 
881 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  35.44 
 
 
362 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.75 
 
 
380 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  30.24 
 
 
402 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  31.75 
 
 
381 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.75 
 
 
380 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  30.24 
 
 
402 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.1 
 
 
358 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.99 
 
 
625 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  29.24 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30.81 
 
 
605 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  29.44 
 
 
402 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  31.28 
 
 
382 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  32.23 
 
 
379 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  31.66 
 
 
366 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.69 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.28 
 
 
381 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  30.81 
 
 
662 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.15 
 
 
358 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.28 
 
 
380 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.12 
 
 
881 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  30.62 
 
 
590 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.05 
 
 
346 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.05 
 
 
383 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.28 
 
 
380 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.28 
 
 
380 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  30.24 
 
 
399 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  29.58 
 
 
366 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  30.24 
 
 
402 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.54 
 
 
702 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  30.24 
 
 
402 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  29.58 
 
 
366 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 
687 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.95 
 
 
684 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.84 
 
 
402 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.01 
 
 
363 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  27.2 
 
 
339 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  33.68 
 
 
379 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  28.46 
 
 
339 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.15 
 
 
358 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  28.28 
 
 
393 aa  85.1  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.67 
 
 
351 aa  85.1  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  30.29 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.32 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>