33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1859 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  89.54 
 
 
327 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  32.5 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  28.96 
 
 
180 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  34.1 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  36.02 
 
 
172 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  36.42 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  30.9 
 
 
181 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  30.46 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  35.75 
 
 
192 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  33.12 
 
 
184 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  30.54 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  31.68 
 
 
175 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  28.81 
 
 
180 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  31.25 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  31.82 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  34.43 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  29.38 
 
 
184 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  29.75 
 
 
178 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  26.59 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  28.12 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  27.85 
 
 
182 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  27.5 
 
 
184 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  26.58 
 
 
181 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  27.61 
 
 
178 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  27.39 
 
 
178 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  26.38 
 
 
178 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  26.11 
 
 
174 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  26.26 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  25.99 
 
 
187 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  28.75 
 
 
184 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  26.38 
 
 
203 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  25.69 
 
 
178 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>