218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0115 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  286  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  93.84 
 
 		 146 aa  272  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  60.9 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  56.03 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  62.6 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  58.27 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 201 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  55.04 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  52.29 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  49.33 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  46.79 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  62.14 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  57.14 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  72.97 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  47.76 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  49.31 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  62.89 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  48.28 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  48.92 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  50 
 
 		 195 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  53.7 
 
 		 183 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  50.37 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  45.16 
 
 		 164 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  44.85 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 243 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 		 242 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 198 aa  88.6  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 289 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  50.96 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  42 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  41.41 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  41.05 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  46.85 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  56.34 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  44.34 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  37.39 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  39.6 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  44 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  40.15 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  34.45 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  46.25 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  41.25 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  44.94 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 249 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  34.65 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 273 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 245 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  30.66 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 269 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  32.35 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  33.82 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 336 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>