22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2997 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  53.33 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  52.59 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  52.59 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  52.14 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  48.85 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  44 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  47.79 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  48.12 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  48.87 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  51.06 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  51.88 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  51.11 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  50.76 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  51.2 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  43.66 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  32.81 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  35.78 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7537  hypothetical protein  24.82 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  33.06 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69350  hypothetical protein  34.95 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  32.23 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>