52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2848 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  69.92 
 
 		 246 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  68.78 
 
 		 246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  68.78 
 
 		 246 aa  355  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  68.78 
 
 		 246 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  45.19 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  44.35 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  43.37 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  44.17 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  36.65 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  36.49 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  36.49 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  36.49 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  36.49 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  36.04 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  36.32 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  36.32 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  35.59 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  36.04 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  32.27 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  33.33 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  37.5 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  31.15 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  31.96 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  35.65 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  32.46 
 
 		 323 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  32.58 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  33.05 
 
 		 376 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  32.03 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  33.19 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  31.09 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  30.59 
 
 		 330 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  31.67 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  29.63 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  28.24 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  27.73 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  30.14 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  29.03 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  30.63 
 
 		 397 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  29.68 
 
 		 317 aa  95.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  27.38 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  29.63 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  31.94 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  28.75 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  32.09 
 
 		 327 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  30.7 
 
 		 318 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  26.95 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  28.89 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  32.37 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  30.94 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  23.29 
 
 		 312 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.271045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>