More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1854 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  80.75 
 
 		 505 aa  839    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 505 aa  1015    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  57.4 
 
 		 515 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3891  propionyl-CoA carboxylase  57.8 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1099  propionyl-CoA carboxylase  57 
 
 		 515 aa  584  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0831  propionyl-CoA carboxylase  55.86 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  56.15 
 
 		 518 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  56.04 
 
 		 519 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3573  putative methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  54.37 
 
 		 519 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1979  propionyl-CoA carboxylase  43.42 
 
 		 518 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  35.74 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  35.97 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  35.64 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  34.79 
 
 		 514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  33.67 
 
 		 517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  37.01 
 
 		 529 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  33.73 
 
 		 531 aa  269  8e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  32.21 
 
 		 516 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  32.61 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  33.89 
 
 		 520 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  35.76 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  33.13 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  32.25 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  31.16 
 
 		 516 aa  264  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  32.61 
 
 		 516 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  32.25 
 
 		 520 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  33.13 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4327  propionyl-CoA carboxylase  35.39 
 
 		 498 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  32.06 
 
 		 516 aa  259  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  32.2 
 
 		 523 aa  259  8e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  33.07 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  32.52 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  33.54 
 
 		 519 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  34.26 
 
 		 498 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  32.11 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  31 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  32.73 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  31.43 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  30.28 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  30.4 
 
 		 516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  30.8 
 
 		 516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  31.78 
 
 		 510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  31.33 
 
 		 518 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  30.82 
 
 		 523 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  30.64 
 
 		 518 aa  253  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  33.33 
 
 		 519 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  32.32 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  31.48 
 
 		 510 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 510 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  32.19 
 
 		 510 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  32.25 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  31.02 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  32.19 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  33.6 
 
 		 530 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  30.82 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  32.25 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  34.15 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  31.41 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  31.14 
 
 		 517 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  32.53 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  31.19 
 
 		 516 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  30.82 
 
 		 520 aa  250  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  30.99 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 514 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  31.72 
 
 		 510 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  31.02 
 
 		 510 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  31.98 
 
 		 535 aa  249  8e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  31.27 
 
 		 524 aa  249  9e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  30.61 
 
 		 510 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  30.89 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  30.68 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  31.91 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  30.88 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  32.24 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  32.29 
 
 		 515 aa  247  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07764  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07580)  41.12 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  31.34 
 
 		 519 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  32.19 
 
 		 510 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.22 
 
 		 512 aa  246  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  32.14 
 
 		 510 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  33.27 
 
 		 519 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  30.75 
 
 		 510 aa  246  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  31.11 
 
 		 510 aa  246  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  32.05 
 
 		 517 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  32.19 
 
 		 510 aa  246  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  31.52 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  31.78 
 
 		 510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  31.12 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  31.52 
 
 		 513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  32.24 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  32.52 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  32.19 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  32.09 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  31.79 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  32.24 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>