More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0764 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  168  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0809  50S ribosomal protein L27  68.75 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.115464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  68.29 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 93 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>