26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0520 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.61 
 
 
241 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  34.29 
 
 
242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.62 
 
 
260 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.02 
 
 
326 aa  95.5  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.86 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  34.69 
 
 
322 aa  91.7  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.48 
 
 
361 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.63 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  28.89 
 
 
175 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  30.43 
 
 
163 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.91 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  26.23 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  25.91 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  27.05 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  28.12 
 
 
168 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  24.46 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  28.57 
 
 
173 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  39.77 
 
 
192 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  26.09 
 
 
203 aa  45.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.45 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  23.5 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
149 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
195 aa  42  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>