18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1477 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  60.5 
 
 		 1370 aa  1583    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  100 
 
 		 1388 aa  2809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.85 
 
 		 1395 aa  484  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  23.58 
 
 		 1121 aa  84.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  22.57 
 
 		 1131 aa  76.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.45 
 
 		 1021 aa  65.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1064 aa  60.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1166 aa  59.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.21 
 
 		 1064 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1066 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  24.56 
 
 		 1037 aa  56.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.71 
 
 		 1003 aa  53.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.4 
 
 		 1068 aa  52  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  23.08 
 
 		 1079 aa  49.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  37.78 
 
 		 1173 aa  48.9  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.89 
 
 		 1426 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.56 
 
 		 1259 aa  45.4  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.61 
 
 		 984 aa  45.1  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>