33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0971 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.62 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  38.89 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  34.58 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  46.75 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.87 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  44.62 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  44.62 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  49.23 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  38.89 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.33 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  38.1 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  35.16 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.99 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.92 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.62 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  34.85 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.94 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.25 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  34.44 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  40.32 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.43 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1801  CRISPR-associated protein Cas2  45.65 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>