38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4677 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 250 aa  523  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  90.76 
 
 		 250 aa  480  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  91.97 
 
 		 250 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  89.96 
 
 		 250 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  81.38 
 
 		 253 aa  434  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  81.05 
 
 		 251 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  80.65 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  80.24 
 
 		 251 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  80.65 
 
 		 251 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.2 
 
 		 243 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.9 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  60.41 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.89 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  60.08 
 
 		 249 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  58.37 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  55.13 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.96 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.06 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.52 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.18 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.64 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  39.45 
 
 		 236 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.75 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.8 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.8 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.36 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.87 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.69 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.42 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.46 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.09 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.07 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.18 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  36.68 
 
 		 236 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  35.91 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  32.06 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0653  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  26.38 
 
 		 525 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1195  O-sialoglycoprotein endopeptidase  31.82 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.112433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>