36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2464 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  100 
 
 		 799 aa  1527    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  62.76 
 
 		 905 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  34.68 
 
 		 892 aa  248  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  31.74 
 
 		 1281 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  35.06 
 
 		 1316 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  33.74 
 
 		 572 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  32.75 
 
 		 575 aa  191  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  32.4 
 
 		 575 aa  177  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.77 
 
 		 752 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  30.23 
 
 		 449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  30.2 
 
 		 466 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  29 
 
 		 1180 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  37.69 
 
 		 526 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  29.11 
 
 		 1279 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  26.5 
 
 		 1361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  28.82 
 
 		 657 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  25.81 
 
 		 4630 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  27.87 
 
 		 649 aa  99  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  39.79 
 
 		 316 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  25.7 
 
 		 1300 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.01 
 
 		 1776 aa  68.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  26.4 
 
 		 1821 aa  65.1  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  36.18 
 
 		 201 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 220 aa  51.6  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  27.38 
 
 		 2042 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  28.7 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.28 
 
 		 1009 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  31.85 
 
 		 981 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  41.33 
 
 		 482 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  28.89 
 
 		 390 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  35.09 
 
 		 462 aa  47.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  41.89 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  29.27 
 
 		 730 aa  46.2  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  41.3 
 
 		 932 aa  45.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  36.36 
 
 		 1245 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>