119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2288 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.73 
 
 		 223 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.73 
 
 		 223 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.52 
 
 		 223 aa  248  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.12 
 
 		 218 aa  206  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.39 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  59.39 
 
 		 218 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.79 
 
 		 218 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.8 
 
 		 227 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.28 
 
 		 215 aa  170  9e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.53 
 
 		 219 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  55 
 
 		 213 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.92 
 
 		 244 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  53.16 
 
 		 218 aa  158  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.62 
 
 		 241 aa  157  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.9 
 
 		 238 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  51.25 
 
 		 239 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  50.31 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  47.02 
 
 		 246 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  46.45 
 
 		 242 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  48.43 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  51.27 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  47.59 
 
 		 205 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.28 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.34 
 
 		 228 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  42.01 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  46.54 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  43.53 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.54 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  43.35 
 
 		 230 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.54 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  48.47 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.1 
 
 		 323 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.71 
 
 		 323 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  42.33 
 
 		 219 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  46.01 
 
 		 223 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  46.01 
 
 		 223 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  43.03 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.77 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.94 
 
 		 225 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.37 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.76 
 
 		 217 aa  120  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  37.42 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  41.88 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  43.9 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  43.9 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.79 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  39.63 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  39.77 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  39.77 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  39.05 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  41.18 
 
 		 333 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  41.72 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.98 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.42 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  40.99 
 
 		 555 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  38.85 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  38.85 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.09 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  43.97 
 
 		 221 aa  94.4  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  28.4 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  26.54 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  26.54 
 
 		 256 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  25.93 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  25.31 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  26.54 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  26.88 
 
 		 215 aa  47.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  25.93 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  32.89 
 
 		 236 aa  45.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.12 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  30.26 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.56 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  36.11 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 203 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>