31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1133 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2253  hypothetical protein  51.82 
 
 		 688 aa  658    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000180404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1568    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3410  hypothetical protein  43.11 
 
 		 243 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  32.56 
 
 		 961 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  32.56 
 
 		 975 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  32.94 
 
 		 975 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  29.27 
 
 		 823 aa  117  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  29.13 
 
 		 823 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1251  exonuclease family protein  29.72 
 
 		 510 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  29.83 
 
 		 823 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  29.56 
 
 		 823 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  30.33 
 
 		 823 aa  110  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.27 
 
 		 825 aa  108  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2284  exonuclease family protein  29.28 
 
 		 376 aa  104  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506505  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0362  hypothetical protein  35.98 
 
 		 270 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  30.06 
 
 		 825 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  61.02 
 
 		 1062 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  39.78 
 
 		 813 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0205  hypothetical protein  29.1 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.76 
 
 		 834 aa  67.4  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  40.38 
 
 		 896 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  39.51 
 
 		 460 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  87.5 
 
 		 771 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  87.5 
 
 		 814 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01537  hypothetical protein  28.09 
 
 		 165 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000664873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  87.5 
 
 		 866 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01545  predicted protein  28.09 
 
 		 168 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000845259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1433  exodeoxyribonuclease 8  91.67 
 
 		 315 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0736689  normal  0.285326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2083  rac prophage; exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsdna exonuclease  87.5 
 
 		 217 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.182666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2028  exodeoxyribonuclease 8  44.44 
 
 		 315 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2022  exodeoxyribonuclease 8  83.33 
 
 		 368 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>