74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2063 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2063  esterase, putative  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.12276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  27.4 
 
 
524 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0713  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.38 
 
 
248 aa  52.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.702118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.57 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  21.61 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  42.11 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
272 aa  49.3  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
311 aa  49.3  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
272 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  23.25 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3348  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 
265 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
267 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 
269 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
267 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  21.12 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  22.69 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.75 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  22.69 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  24.49 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
329 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  20.08 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  23.38 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  23.78 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  27.37 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.73 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30 
 
 
372 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  21.76 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  23.79 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
421 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  21.26 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3075  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.07 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.698779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  19.6 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  28.38 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  20.52 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  22.47 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.68 
 
 
518 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  19.81 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  22.03 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  23.5 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.19 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
315 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  23.55 
 
 
273 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0117  alpha/beta hydrolase  22.59 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  22.03 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
319 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  21.13 
 
 
362 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  20.66 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>