36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1949 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1949  transcriptional regulator TcaR  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2427  regulatory protein MarR  63.09 
 
 		 151 aa  201  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.753969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2381  MarR family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 151 aa  201  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  31.48 
 
 		 151 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 153 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 165 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  31.48 
 
 		 151 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.04 
 
 		 283 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 164 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 153 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 153 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 153 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>