More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1124 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 
448 aa  919    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000682714  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  82.33 
 
 
448 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0163968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1616  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  82.33 
 
 
448 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.309346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2407  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.13 
 
 
435 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.58 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3013  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.12 
 
 
436 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0462  superfamily II DNA/RNA helicase  43.12 
 
 
446 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4366  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.02 
 
 
436 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000110703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0833  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.8 
 
 
436 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  hitchhiker  0.0000000000789178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4419  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  45.02 
 
 
436 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000144636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4403  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.8 
 
 
436 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000107871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4307  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.8 
 
 
436 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.163670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4187  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.8 
 
 
436 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4025  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.8 
 
 
436 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4035  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.8 
 
 
436 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000492575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.8 
 
 
436 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000163692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.26 
 
 
436 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1584  superfamily II DNA/RNA helicase  41.44 
 
 
454 aa  363  4e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0532  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.69 
 
 
457 aa  353  4e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000013881  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1285  superfamily II DNA/RNA helicase  40.89 
 
 
454 aa  352  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0289  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.44 
 
 
447 aa  343  4e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1664  superfamily II DNA/RNA helicase  40.77 
 
 
447 aa  341  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl273  ATP-dependent RNA helicase  39.49 
 
 
460 aa  323  3e-87  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00339655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0420  superfamily II DNA/RNA helicase  39.5 
 
 
464 aa  300  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0500  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.39 
 
 
453 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0107165  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0686  ATP-dependent RNA helicase  33.26 
 
 
445 aa  265  1e-69  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.2 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  36.02 
 
 
656 aa  253  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.6 
 
 
527 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
532 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  35.16 
 
 
572 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  36.67 
 
 
485 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  35.1 
 
 
529 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.77 
 
 
538 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.82 
 
 
525 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.82 
 
 
528 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  34.82 
 
 
528 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.82 
 
 
528 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.82 
 
 
528 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.77 
 
 
498 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.82 
 
 
525 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  34.82 
 
 
533 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  34.82 
 
 
528 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.54 
 
 
511 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.06 
 
 
467 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.47 
 
 
509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.44 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.44 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5247  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
513 aa  244  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  36.59 
 
 
527 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  35.83 
 
 
530 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.75 
 
 
528 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.93 
 
 
530 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.73 
 
 
466 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.07 
 
 
590 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  35.21 
 
 
521 aa  241  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 
482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  34.01 
 
 
590 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5370  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.07 
 
 
481 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200249  hitchhiker  0.000118205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5135  ATP-dependent RNA helicase  34.44 
 
 
481 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.557571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5548  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.17 
 
 
481 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5307  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.17 
 
 
481 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.34 
 
 
532 aa  239  8e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5703  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.17 
 
 
481 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5149  ATP-dependent RNA helicase  34.17 
 
 
481 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.63 
 
 
532 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5577  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  33.52 
 
 
481 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.91 
 
 
594 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.71 
 
 
460 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 
610 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  34.96 
 
 
513 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.01 
 
 
531 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.73 
 
 
565 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5639  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.07 
 
 
481 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0860387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5592  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.07 
 
 
481 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.99386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.08 
 
 
634 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.54 
 
 
599 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  30.46 
 
 
528 aa  237  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.49 
 
 
550 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.52 
 
 
623 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  35.21 
 
 
580 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.37 
 
 
640 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.37 
 
 
640 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.37 
 
 
640 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.08 
 
 
605 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.63 
 
 
541 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.37 
 
 
640 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.37 
 
 
640 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 
622 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.989648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  34.33 
 
 
495 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.92 
 
 
458 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  33.8 
 
 
589 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.24 
 
 
637 aa  233  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  33.8 
 
 
589 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.07 
 
 
589 aa  233  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.36 
 
 
457 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  34.08 
 
 
644 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000079582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.98 
 
 
622 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>