274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1003 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  100 
 
 		 318 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  100 
 
 		 318 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  85.22 
 
 		 318 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  85.22 
 
 		 318 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  65.27 
 
 		 318 aa  447  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  65.59 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  65.59 
 
 		 318 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  65.59 
 
 		 318 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  65.92 
 
 		 318 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  65.27 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  65.27 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  65.27 
 
 		 318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  65.27 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  65.27 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  64.63 
 
 		 318 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  61.46 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  58.1 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  58.1 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  54.4 
 
 		 322 aa  362  3e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  53.38 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  50.96 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  315  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  315  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  50.48 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  47.92 
 
 		 264 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  309  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  50.47 
 
 		 300 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  47.92 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  47.92 
 
 		 264 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  50.16 
 
 		 264 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  48.26 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  48.39 
 
 		 272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  49.53 
 
 		 290 aa  305  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  48.46 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  48.46 
 
 		 277 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  47.92 
 
 		 283 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  48.06 
 
 		 270 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  49.2 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  47.28 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  46.3 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  48.06 
 
 		 265 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  47.92 
 
 		 264 aa  302  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  48.91 
 
 		 286 aa  301  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  46.98 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  46.98 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  46.98 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  48.88 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  48.14 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  46.45 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  49.52 
 
 		 264 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  46.82 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  47.91 
 
 		 264 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  48.24 
 
 		 264 aa  299  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  47.06 
 
 		 276 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  48.87 
 
 		 264 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  48.23 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  47.3 
 
 		 266 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  49.2 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  47.91 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  46.96 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 274 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  47.59 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  47.91 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  48.55 
 
 		 264 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  48.06 
 
 		 263 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  47.59 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  47.59 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  47.59 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  47.28 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  48.24 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  47.59 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  47.59 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  47.27 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  47.27 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  48.24 
 
 		 264 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  46.01 
 
 		 264 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  46.96 
 
 		 265 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0234  thymidylate synthase  45.69 
 
 		 264 aa  295  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  46.33 
 
 		 264 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  48.24 
 
 		 280 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  47.27 
 
 		 264 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  47.27 
 
 		 264 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  48.24 
 
 		 264 aa  295  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  47.59 
 
 		 264 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  46.62 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  48.56 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  47.27 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  48.24 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  47.53 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  48.56 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>