More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0509 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  524  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  86.36 
 
 
275 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  86.36 
 
 
275 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  44.07 
 
 
266 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  45.97 
 
 
266 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  45.97 
 
 
266 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  45.97 
 
 
266 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  45.97 
 
 
262 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  44.76 
 
 
266 aa  208  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  45.56 
 
 
266 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  45.56 
 
 
262 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  44.76 
 
 
266 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  44.35 
 
 
266 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  45.45 
 
 
272 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  40.27 
 
 
300 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  45.52 
 
 
139 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  25.65 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  28.24 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.35 
 
 
307 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.74 
 
 
315 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.4 
 
 
306 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.4 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  27.48 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.83 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  27.34 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.59 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  26.46 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  26.04 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  26.62 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  27.44 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  26.3 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.77 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  26.8 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.59 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  27.78 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.59 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.63 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.01 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  26.16 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0509  hypothetical protein  35.43 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  25.3 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  25.1 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  24.14 
 
 
2798 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  22.92 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  25.17 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  24.13 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  25.51 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  26.91 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  28.38 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.81 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  23.51 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  27.95 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  25.29 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  25.66 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  25.29 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  25.75 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  25.19 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  25.75 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  25.75 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  25.86 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  22.01 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  29.35 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  23.53 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  23.53 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  22.5 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  27.53 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  23.55 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  26.47 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  21.72 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.52 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  21.64 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1544  YunE  45.69 
 
 
131 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122236 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  22.59 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  23.64 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  25.29 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  27.89 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  28.92 
 
 
354 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  25.2 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.21 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  24.55 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  26.83 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  25.98 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>