More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2514 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  100 
 
 
125 aa  256  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  99.2 
 
 
125 aa  253  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  58.91 
 
 
139 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  50.41 
 
 
143 aa  140  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  45.97 
 
 
129 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  51.75 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  51.75 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  51.75 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.56 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  51.22 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  45.83 
 
 
135 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  42.52 
 
 
304 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  44.55 
 
 
135 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  44.95 
 
 
129 aa  110  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  44.95 
 
 
129 aa  110  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  44.95 
 
 
129 aa  110  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  44.95 
 
 
129 aa  110  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  44.95 
 
 
129 aa  110  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  65.33 
 
 
170 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  44.95 
 
 
129 aa  110  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  43.64 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  50.42 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  43.64 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  50.42 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  47.41 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  47.41 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  48.65 
 
 
142 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  48.65 
 
 
142 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  50 
 
 
254 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  50 
 
 
254 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  50 
 
 
254 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  50 
 
 
254 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  50 
 
 
254 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  46.55 
 
 
138 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  45.95 
 
 
123 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  45.95 
 
 
123 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  45.95 
 
 
123 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.14 
 
 
252 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  45.9 
 
 
123 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  45.9 
 
 
123 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  45.9 
 
 
123 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  45.9 
 
 
123 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  45.9 
 
 
123 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  50 
 
 
254 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  50 
 
 
254 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  50 
 
 
254 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  50 
 
 
254 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  47.75 
 
 
142 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  50 
 
 
254 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  50 
 
 
254 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  50 
 
 
303 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  50 
 
 
303 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3276  transposase  49.09 
 
 
130 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  40.68 
 
 
149 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  50 
 
 
303 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  46.85 
 
 
181 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  46.85 
 
 
181 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  46.85 
 
 
181 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  46.85 
 
 
181 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  46.85 
 
 
181 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  47.22 
 
 
142 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  47.22 
 
 
142 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  46.15 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  46.15 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.8 
 
 
281 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  44.35 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  48.35 
 
 
87 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  39.82 
 
 
122 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  39.82 
 
 
122 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  40.34 
 
 
260 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  39.82 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  39.84 
 
 
253 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  39.84 
 
 
253 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  39.84 
 
 
254 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  39.84 
 
 
253 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  44.79 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  53.09 
 
 
294 aa  90.5  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  44.79 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  43.24 
 
 
259 aa  90.5  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  44.79 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  40.52 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  40 
 
 
249 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  40.52 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  40.52 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  40.52 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>