More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2160 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 122 aa  243  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  83.47 
 
 		 122 aa  201  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 122 aa  194  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 128 aa  193  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 125 aa  193  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 125 aa  193  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  83.47 
 
 		 123 aa  193  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 133 aa  192  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  77.87 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  77.87 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  75.21 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  76.86 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  76.03 
 
 		 124 aa  190  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  77.05 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 125 aa  191  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  76.03 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 125 aa  190  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 127 aa  189  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  72.73 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 136 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 125 aa  189  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0449  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245069  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0482  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00887343  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0621  ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4553  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  72.73 
 
 		 135 aa  189  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  73.55 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  73.55 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  78.33 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4754  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0069971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  78.33 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5084  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000372419  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1859  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000297311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 127 aa  188  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 126 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>