More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1958 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
353 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.04 
 
 
342 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.17 
 
 
341 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.31 
 
 
341 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62 
 
 
341 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.6 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.46 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  58 
 
 
347 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  56.29 
 
 
347 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  56.29 
 
 
347 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 
347 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
364 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
364 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.56 
 
 
344 aa  342  4e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.52 
 
 
347 aa  335  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.86 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.86 
 
 
347 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
346 aa  199  6e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.83 
 
 
349 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
350 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39 
 
 
349 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
344 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 
337 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
340 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.38 
 
 
346 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 
354 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 
356 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  38.12 
 
 
348 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
341 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.57 
 
 
346 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
341 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
342 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
344 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.78 
 
 
343 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  35.99 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.38 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.06 
 
 
341 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
335 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
336 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
342 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.04 
 
 
341 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.57 
 
 
346 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.77 
 
 
341 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 
341 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
348 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
341 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.77 
 
 
357 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
342 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.73 
 
 
328 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.77 
 
 
341 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
344 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
342 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.34 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.17 
 
 
351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
342 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.06 
 
 
343 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.43 
 
 
344 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.43 
 
 
344 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.01 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.77 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
344 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
342 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
349 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.54 
 
 
347 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
348 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.06 
 
 
342 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
344 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34 
 
 
336 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.29 
 
 
349 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
340 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.05 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.03 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
347 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.48 
 
 
341 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
344 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
362 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
338 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 
344 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 
347 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.71 
 
 
339 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 
341 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>