19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0773 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 534 aa  1057    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 546 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  28 
 
 		 535 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.54 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 544 aa  87  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  26.13 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  22.34 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  38.4 
 
 		 148 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  22.69 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  23.51 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  22.36 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 		 522 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 506 aa  50.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  24.6 
 
 		 528 aa  47.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  23.48 
 
 		 504 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 		 455 aa  43.5  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>